از کتاب های محمدحسن محمدی مظفر اطلاعات بیشتر نظام مستقل و به هم پیوسته فکری امامیه نخستین در نظریه معرفت؛ تبیین پارادایمیک معرفت اضطراری امامیه حسین نعیم آبادی, محمدحسن محمدی مظفر اطلاعات بیشتر نقد شبهۀ ولایت‌نداشتن حضرت علی (ع) در زمان حیات رسول اکرم (ص) در آیۀ ولایت رقیه یوسفی, محمد امین مومنی, محمدحسن محمدی مظفر
